Het is erg moeilijk om een besmetting met MRSA te voorkomen. Het beste is om de bronnen te vermijden, maar dit is lang niet altijd mogelijk. Als je bijvoorbeeld een bezoek in het ziekenhuis of aan een veehouderij hebt gebracht, dan is een goede hygiëne belangrijk. Was na een bezoek altijd je handen. De bacterie kan ook in het vlees terecht komen; verhit het vlees goed voordat je het opeet. Dit geldt vooral bij rood vlees.