De bekendste bijwerking van biologische reumaremmers is een verhoogde gevoeligheid voor infecties. Dit kan zich bijvoorbeeld uiten in een luchtweginfectie, een longontsteking of gordelroos. Als er na het toedienen van biologicals een vermoeden bestaat dat je een infectie hebt, wordt de behandeling (tijdelijk) gestopt. Je krijgt dan antibiotica om de infectie te bestrijden.
Naast infecties kan het gebruik van biologische reumaremmers ook leiden tot koorts, hoofdpijn of een tekort aan witte bloedlichaampjes. Op de plek van de injectie kan huidirritatie ontstaan: roodheid, jeuk, een zwelling of een blauwe plek.
In sommige gevallen ontwikkelt het lichaam zelf antistoffen tegen de biologische reumaremmers. Door die antistoffen wordt de werking van het medicijn verminderd en soms zelfs tenietgedaan. Doordat er verschillende soorten biologicals bestaan, is het mogelijk dat een ander medicijn wel effect heeft.