Als de diagnose hypoplastisch linkerhart is gesteld, wordt het kind direct behandeld met prostaglandine. Dit medicijn zorgt ervoor dat de verbinding tussen de longslagader en de lichaamsslagader weer geopend wordt. Hoewel het bloed niet de gebruikelijke route neemt, wordt het lichaam op deze manier wel voorzien van zuurstofrijk bloed. Het kind kan weer bijkomen.