Voor orthorexia nervosa bestaat nog geen vaste behandeling. Herkent een huisarts de klachten dan verwijst hij naar een psychiater of voedingsdeskundige. Het behandelen van orthorexia nervosa is vooral gericht op iemand weer normaal leren omgaan met eten. Dit kan bijvoorbeeld met cognitieve gedragstherapie.
Tijdens deze therapie leren mensen met eetstoornissen hoe ze aandacht kunnen besteden aan een volwaardig voedingspatroon. Ze krijgen een beter beeld van wat wel gezond is en wat niet. Verder leren ze over de gevolgen van ondervoeding. De behandeling van orthorexia nervosa lijkt op de behandeling van andere eetstoornissen zoals anorexia nervosa of boulimia. Professionele begeleiding is van groot belang om de kans van slagen zo groot mogelijk te maken.