De behandeling van koemelkallergie bestaat uit het aannemen van een dieet. Bij koemelkallergie bij een baby die borstvoeding krijgt, houdt dit in dat de moeder geen melkproducten meer mag nuttigen zolang zij borstvoeding geeft. Als de baby overgaat op flesvoeding, dan moet dit een hypo-allergene flesvoeding zijn. Wanneer het kindje gewoon gaat eten, moeten die koemelkvrije producten zijn.
Soms is het bij een baby met koemelkallergie ook nodig om andere dieeteisen te stellen, om te voorkomen dat het kind ook nog andere allergieën ontwikkelt.
