De behandeling van een infectie hangt af van het soort verwekker en de plaats waar deze zich bevindt.
Bacteriën kunnen relatief eenvoudig bestreden worden met antibiotica. Afhankelijk van de ernst van de infectie en de bereikbaarheid van de ontstekingshaard, moeten antibiotica in tabletvorm of via en infuus gegeven worden. Antibiotica maken de bacteriën dood en nemen de klachten weg. Ook parasitaire infecties kan een behandeling met antibiotica volstaan. Tegen schimmelinfecties bestaan eveneens goed werkzame medicijnen, zogenaamde antimycotica, die verkrijgbaar zijn in onder andere tablet-, crème- en drankvorm. Virussen zijn moeilijker te behandelen. Er bestaan antivirale middelen die de celdeling van virusdeeltjes tegengaan, maar die de virusinfectie nog niet goed kunnen doen verdwijnen.
