Bij de behandeling van zuigflescariës is het allereerst van belang om de oorzaak weg te nemen. Leer je kind af om constant uit een flesje te drinken. Een fopspeen kan hierbij helpen. Afhankelijk van de ernst kan de aandoening vanzelf genezen. Soms zijn de tanden zodanig aangetast dat er een tandarts aan te pas moet komen. De behandeling kan bestaan uit het vullen van gaatjes, eventueel onder narcose. Sommige ontstoken melktanden kunnen een risico vormen voor het blijvende gebit, waardoor ze getrokken moeten worden. Het is dus een fabeltje dat tanden die nog gewisseld moeten worden, niet hoeven worden gevuld.