Er is geen behandeling om Factor-V-Leiden te stoppen. Wel kunnen bloedverdunners de kans op trombose verkleinen. Deze medicijnen krijg je alleen voorgeschreven als je al een keer trombose hebt gehad. Als je tijdelijk een nog grotere kans op trombose hebt, bijvoorbeeld door een operatie, gips, ziekte of zwangerschap, kun je bloedverdunners krijgen totdat het risico op trombose voorbij is.