In uitzonderlijke gevallen kan salmonella in de bloedbaan terechtkomen, waardoor organen, gewrichten en botten aangetast worden. In dit geval bestaat er een grote kans dat je met Salmonella typhi of Salmonella paratyphi bent besmet. Bij deze types kunnen klachten heel heftig zijn. Er ontstaan gewrichtsontstekingen of langdurige buikklachten, zoals verstopping, krampen of diarree. Deze salmonellabacteriën kunnen ook een enkele keer botontsteking, hartproblemen en abcessen veroorzaken.
In sommige gevallen is salmonella dodelijk. Dit kan voorkomen als de patiënt uitdroogt en de nierwerking stopt of als er een bloedvergiftiging en shock optreedt.