De ziekte van Huntington is niet te genezen of te stoppen, maar bij sommige klachten helpen medicijnen. Neuroleptica remmen onwillekeurige bewegingen en helpen tegen wanen of hallucinaties. Deze medicijnen hebben echter wel vaak vervelende bijwerkingen zoals sufheid, slaperigheid, duizeligheid en depressiviteit. Tegen epileptische aanvallen, wat soms bij de juveniele vorm optreedt, worden anticonvulsiva voorgeschreven. Spierverslappende middelen kunnen helpen tegen spierstijfheid bij kinderen.
Patiënten kunnen ook baat hebben bij paramedische behandelingen. Een logopedist kan helpen bij de spraak- en slikproblemen. Op de lange duur zal het spreken echter zo moeilijk worden dat communicatie met behulp van bijvoorbeeld een computer moet.