De ziekte van Hashimoto wordt behandeld door de hoeveelheid schildklierhormoon in je lichaam aan te vullen. De huisarts geeft je hiervoor medicijnen: het schildklierhormoon levothyroxine. Na verloop van tijd kun je mogelijk een lagere dosis schildklierhormoon innemen als de schildklierfunctie dat toelaat.
Verder is het advies van de arts om minstens één keer per jaar je schildklierfunctie te laten controleren. Dit kan gewoon bij de huisarts.