In de meeste gevallen is behandeling van goedaardige prostaatcysten niet nodig. Veroorzaken de cysten echter een aanhoudende prostaatontsteking? Dan kunnen de zwellingen geopend worden door ze via de plasbuis aan te prikken. De cystewand blijft dan achter in de prostaat.
Verwijdering door TURP
Ook wanneer de cyste erg groot is en voor prostaatklachten zorgt, kan deze worden verwijderd door een trans urethale resectie prostaat (TURP). Hierbij wordt een gedeelte van de prostaat via de plasbuis verwijderd. Deze ingreep vindt plaats onder algehele of plaatselijke verdoving (ruggenprik).