De standaardbehandeling bij een darmperforatie is een operatie. Tijdens de operatie zal je arts het gat in je darmen dicht maken. Als je darminhoud al naar je buikholte gelekt is, dan zal je buikholte gespoeld worden om zo te proberen om een ontsteking te voorkomen. Na de operatie zal je enige tijd in de gaten gehouden worden in het ziekenhuis en zal je antibiotica krijgen. De antibiotica is nodig om de al bestaande ontsteking in je buikholte tegen te gaan. Soms wordt er ook een spoeldrain aangelegd, een slangetje om dagelijks de buikholte te spoelen.
Om je darmen de kans te geven op herstel na een darmperforatie is het soms nodig om tijdens de operatie (een tijdelijk) stoma aan te brengen. Door een stoma wordt je darm ontzien.